核苷酸辅助因子对不同类型的核心启动子具有特异性

2021-12-20 00:39:04 来源:

酪氨酸辅助系数（transcriptional cofactor， COF）在增强子与转录二者之间传达调控线索，是酪氨酸作用于和线粒体的内部效应物。虽然已证实某些COF比其他COF更偏好某些转录类别，但是并不不尽相同COF对并不不尽相同转录显示不止的内在特异性的程度尚不清楚。在一项新的研究成果之中，来自奥地利德累斯顿生物之中心原子免疫学研究成果所的研究成果人员在黑腹酵母菌S2巨噬细胞之中采用高通量转录活性测定来择优23个COF作用于7.2万个候选内部转录（core promoter， CP）的控制能力。相关研究成果结果于2019年5月15日在线发表在Nature学术刊物上，博士论文开头为“Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters”。这些研究成果人员观察到内部转录的差别作用于，这证明COF与特定类别的内部转录二者之间不存在着并不不尽相同的调节偏好或者说“兼容性（compatibilities）”。这些功能并不不尽相同的内部转录在TATA盒、下游转录线圈（downstream promoter element， DPE）和TCT基序等已知的序列线圈上差别性地钼，并在内源性底物上显示不止并不不尽相同的肌动蛋白特点。值得注意的是，这些内部转录类别在它们的H3K4me3和H3K4me1标记上不存在并不不尽相同的相对丰度，这证明这些鸟嘌呤修饰意味著能够界定反式调节系数而不是转录和增强子类别的顺式调节线圈。这些研究成果人员证实在人巨噬细胞和另外两种酵母菌巨噬细胞之中证实了并不不尽相同COF-内部转录兼容性的不存在。为此，他们辨认出了分别偏好TATA盒和CpG岛转录的COF。COF和内部转录二者之间的并不不尽相同兼容性能够推论并不不尽相同的增强子如何特异性地作用于并不不尽相同组的基因、不尽相同基因内的可变转录（alternative promoter）和不尽相同转录内的并不不尽相同酪氨酸起始底物。综上所述，COF-内部转录兼容性意味著是酵母菌和有机体等并不不尽相同物种之中并不不尽相同酪氨酸程序的基础。原始不止处：Haberle V1， Arnold CD1， Pagani M1， et al.Transcriptional cofactors display specificity for distinct types of core promoters.Nature. 2019 May 15. doi： 10.1038/s41586-019-1210-7. [Epub ahead of print]